Tenemos que tener claras las ventajas y desventajas de cada uno. El primero que vamos a comentar es Prestashop:

Ventajas: Es la plataforma más usada en España, es de código abierto, es ideal para pequeñas y medianas empresas, es facil de instalar, tiene muchos módulos para añadir diferentes funciones, facilita el posicionamiento de Seo, es multiidioma, es fácil de festionar.
Desventajas: Los mejores módulos son de pago, asi que no sera gratis, si quieres añadir algunas fichas complejas, tendrás que tocar el código

Shopify:
Ventajas: Es la que últimamente esta despuntando, ideal para desarrollar pequeños eCommerce, es un software en la nube por lo que pagas una cuota por su uso, en pocos pasos tienes tu tienda online, tiene diferentes plantillas profesionales

Desventajas: El software no se puede descargar ni modificar, si quieres cambiar el código tendrás que pagar, si quieres ampliar el sitio tienes que pagar los diferentes módulos, el Seo funciona muy bien a nivel de Inglés pero no en otros idiomas, los servidores están ubicados en EEUU, el multi-idioma no funciona del todo bien.

WooCommerce:
Ventajas: El plugin gratis se añade en WOrdPress, ideal para pequeñas empresas, no necesitas servidores dedicados, es fácil de utilizar, cualquier plugin de seo de wordpress se puede trabajar, hay mucha información para aprender y suele ser bastante económico
Desventajas: Funciona sobre un CMS, necesitas actualizar el CMS y los plugins, no es multitienda, con 300 articulos o mas, empieza a dar fallos, es muy vulnerable y puede salir bastante caro ya que muchas funcionalidades tienes que pagar ya que no están incluidas.

Magento:
Ventajas: Es utilizada para grandes empresas, ideal para multitiendas, es multibilingue y multimoneda, tiene infinidad de módulos para añadir, es bueno para el posicionamiento SEO, puedes crear una ficha completa sin tener que tocar el código, sus versiones son muy fiables y es muy seguro.
Desventajas: Necesitas un alojamiento propio, es dificil de administraarlo, para el código tienes que contratar programadores expertos, es dificíl su utilización y su precio es caro

En mi caso comentaré Woocommerce:
WooCommerce es una de las herramientas de e-commerce más conocidas de la actualidad. Es un plugin gratuito para añadir a un sitio WordPress, un complemento web fácil y rápido de instalar con el que cualquier persona podrá experimentar qué es el comercio electrónico.

Y es este precisamente el principal atractivo de la plataforma, ya que se trata de una de las formas más accesibles crear una tienda online, sobre todo si se tiene experiencia en Wordpress. Este plugin permite que los usuarios de la plataforma puedan colocar una pasarela de pago, un panel para la administración de productos o un carrito de compras entre otras herramientas, dentro de sus blogs o sitios web.

WordPress destaca por ser muy sencillo de aprender. Por eso, si no tienes grandes conocimientos técnicos y no deseas invertir en este tipo de ayuda, WooCommerce puede ser una gran opción para tí.

Ten en cuenta, eso sí, que aunque se trate de un plugin gratuito, si quieres utilizar otras herramientas que la plataforma provee, necesitarás hacer inversiones adicionales.

Finalmente, con WooCommerce no resulta sencillo escalar. Una tienda que comience a crecer, y a atraer nuevos clientes, tendrá que migrar eventualmente a otros servicios o bien a un hosting que esté preparado para aportar soluciones de escalabilidad. Aunque esto pueda verse como un “pero”, es un atractivo si estás dando tus primeros pasos en e-commerce: podrás crear tu tienda sin hacer apenas inversión.